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博士生导师

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蔡禄

蔡禄 男(19648月)

博士 教授 内蒙古呼和浩特市人 博士生导师

电话:0472-5951945

传真:0472-5951945

E-mailnmcailu@163.com

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教育经历

1980.09-1984.07  内蒙古大学物理系学习, 理学学士

1984.09-1987.07  内蒙古大学物理系学习, 生物物理学硕士

1996.09-2000.70  内蒙古大学物理系学习, 生物物理学博士

2000.09-2002.09  清华大学生物系, 生物信息学博士后

2002.10-2003.11  美国德克萨斯A & M大学系统健康科学中心,生物科学与技术研究所,访问学者。

2014.10-2015.04  美国凯斯西储大学医学院遗传学与基因组学系,访问学者

工作经历

1987.8-1990.10  内大物理系,助教

1990.10-1991.4  内大物理系,讲师

1991.5-1995.09  包头钢铁学院基础部,讲师

1995.10-2000.6  包头钢铁学院基础,副教授

2000.7-2003.12  包头钢铁学院生物与化学工程系,教授,系主任

2004.1-2004.12  内蒙古科技大学生命科学学院,教授,院长,硕士生导师。

2005.1-2009.01  内蒙古科技大学生物与化学工程学院,教授,院长,博士生导师。

2009.2-2016.02  内蒙古科技大学数理与生物工程学院,教授,院长,博士生导师。

2016.3-今内蒙古科技大学生命科学与技术学院,教授,院长,博士生导师。

研究方向

开展生物信息学、表观遗传学、生物质能源化利用、环境生物学等领域的研究。曾经从事研究方向有:基因序列的信息学分析、DNA结构、蛋白质-蛋白质相互作用及网络等。目前主要关注基因表达调控在表观遗传学层面的调控机制,开展核小体定位、组蛋白修饰、RNA可变剪接等问题研究。近几年,结合地区经济建设及环境问题,积极开展乌梁素海及包头黄河湿地综合治理及其与区域生态安全的关系、城市生活垃圾资源化利用、工业废水生物技术综合治理等应用技术研究。

●科研成果获奖

1.成果名称:相互作用网络及染色质结构水平遗传信息组织、传递规律的生物信息学研究,获奖等级:内蒙古自治区自然科学奖一等奖,2015.11

2.成果名称:内蒙古自治区2013年度中青年科技创新奖,201411

3.成果名称:人类基因组三核苷酸重复序列的结构和动力学及其在相关领域中应用的研究,获奖等级:内蒙古自治区科技进步奖一等奖,2006.12

4.成果名称:基因序列的信息学研究,获奖等级:国家自然科学奖三等奖,199912

5.成果名称:关于Cu2S/CdS多晶薄膜异质结太阳电池电导机构的研究,获奖等级:冶金部科技进步三等奖,1995.12

●教学成果获奖

1.宝钢教育基金会优秀教师奖,2006

2.内蒙古自治区第三届高等学校教学名师奖,2009

3.成果名称:普通工科院校数理教学基地建设的思考与实践,获奖等级:内蒙古自治区教学成果奖一等奖,2014.2,蔡禄张雪峰石琳赵团杨友松

4.成果名称:以课程体系建设促进生物技术专业创新人才培养的研究与实践,获奖等级:内蒙古科技大学教学成果奖一等奖,2015.11,蔡禄、赵秀娟、巩东辉、杜志强、王晶研、李珺

5.成果名称:工科院校数理教学基地建设的思考与实践,获奖等级:内蒙古科技大学教学成果奖一等奖,2013.7,蔡禄任慧平张雪峰石琳赵团

6.成果名称:基础生物学验示范中心开放实验室的建设与管理,获奖等级:内蒙古科技大学教学成果奖二等奖,2011.11

7.成果名称:生物技术专业实验课教学模式的探讨和研究,获奖等级:内蒙古科技大学教学成果奖二等奖,2011.11

8.成果名称:本科生提前进入实验室参加科学研究的探讨,获奖等级:内蒙古科技大学教学成果奖二等奖,2009.8

9.成果名称:生物工程专业建设研究与实践,获奖等级:内蒙古科技大学教学成果奖二等奖,2006.9

●科研项目

1.国家自然科学基金面上项目,可变剪接相关生物大分子相互作用网络的构建与分析(61271448),2013.1-2016.12

2.国家自然科学基金面上项目,基于基因组序列和结构特征的核小体定位的理论和实验研究(61072129), 2010.1-2013.12

3.国家自然科学基金地区项目,基于蛋白质二级结构的蛋白质相互作用及网络的研究(60761001),2008.1-2010.12

4.国家自然科学基金地区项目,与人遗传病相关的DNA重复序列柔性的实验和理论研究(30460038),2005.1-2007.12

5.包头市企业创新能力建设项目,内蒙古自治区表观遗传学与生物信息学科技创新团队(20140401)2015.1-2016.12

6.内蒙古自治区重大基础研究开放课题,城市有机废弃物厌氧发酵过程强化的研究(201503001-4-3),2015.1-2017.12

7.内蒙古自治区重点实验室支持项目,能源微藻制备生物柴油工艺集成,2012.1-2014.12

8.生物大分子国家重点实验室开放课题,DNA序列特征对酵母核小体定位及自主复制序列活性的调控作用,2011.1-2012.12

9.教育部春晖计划,秸秆制备燃料乙醇的研究(教外司留[2008]704号),2008.7-2010.7

10.内蒙古自治区高等学校科学基金,秸秆化学法合成乙醇基燃料的产业化(NJzy08233)2009.1-2010.12

11.包头市科技攻关项目,生物法制备燃料乙醇(2008Y1002-1),2008.1-2009.12

12.内蒙古人才建设基金,蛋白质相互作用的预测及网络的构建,2007.1-2008.12

13.内蒙古自治区自然科学基金重点项目,DNA动力学结构统计力学模型和实验检验(2005080101022005.1-2007.12

14.留学回国人员科研启动基金,与人遗传病相关的重复序列结构与遗传不稳定性关系研究, 2006.9-2008.9  (教外司留[2006]331)

15.包头市科技攻关项目,肉苁蓉大规模培养、药用成分提取的产业化研究,2006.9-2008.12

16.内蒙古自治区高等学校科学基金,蛋白质相互作用的预测及相互作用网络的构建 (NJ02116)

17.中国博士后科学基金,基因组序列动力学结构研究,2001.9-2002.9

18.内蒙古自治区自然科学基金,与遗传病有关的三核苷酸重复DNA的结构和动力学研究 (20001302) 2000.9-2002. 9

●教研项目

1.内蒙古自治区十一五高等教育科学规划课题,科研反哺教学,促进创新人才培养研究与实践,2012.9-2014.9

2.内蒙古自治区十一五高等教育科学规划课题,工科院校理科教学基地建设的思考与实践,2012.9-2014.9

3.内蒙古科技大学教学改革重点项目,以课程体系建设推进生物技术专业创新人才培养(JY2011013),2012.1-2013.12

4.内蒙古科技大学教学改革项目,本科生提前进入实验室参加科学研究工作的探讨,2007.10-2008.10 JY2007048

●荣誉称号

1.2010年,国务院特殊津贴专家

2.201510月,内蒙古自治区2014年度杰出人才奖

3.2012年,自治区草原英才培养人才三类

4.2012年,十一五自治区科技计划执行优秀奖

5.2007年,内蒙古自治区优秀教师

6.2004年,内蒙古自治区有突出贡献中青年专家

7.2002-2015年,内蒙古自治区321人才工程一层次人才

8.2002年,内蒙古教育厅111人才工程二层次人才

9.2015年,包头市鹿城英才

10.2012年,包头市“5512工程领军人才

11.2008年,包头市新世纪人才工程首批人选拔尖人才

●其他学术荣誉

1.教育部第三轮学科评估专家,2012

2.20052009年国家自然科学基金会审专家

3.2008 年自治区自然科学奖学科组及终评委员会评审专家

4.自治区突贡、特贴专家评审专家

5.教育部留学回国人员基金评审专家,2008-2013

6.自治区自然科学基金数理学科评审专家

7.中国生物物理学会会员

8.中国细胞生物学学会会员

9.内蒙古生物工程学会副理事长

10.内蒙古自治区化工学会常务理事

11.国内外学术刊物BioinformaticsJ Membrane BiologyJ Theor Biol.GeneMol. Biol. Rep.PlosOne,生物物理与生物化学进展,生物物理学报审稿人

12.多次国际、国内学术会议担任学术委员会委员、分会主持人或作口头报告

●学科及教学平台

1.自治区基础生物实验教学示范中心,负责人,2007

2.自治区生物工程品牌专业,负责人,2008

3.生物学硕士学位一级学科授权点,带头人,2010

4.自治区生物质能源化利用重点实验室,负责人,2011

5.自治区微生物学优秀教学团队,负责人,2011

6.自治区生物信息学精品课,负责人,2011

7.校级生物学重点学科,负责人,2010

8.校级可再生资源生物技术综合利用创新团队,负责人,2010

9.包头市“5512工程创新团队,负责人,2012

10.自治区表观遗传学与生物信息学创新团队,负责人,2013

●代表性论著

SCI收录论文(*号为责任作者)

1.Guoqing Liu, Yongqiang Xing, Hongyu Zhao, Jianying Wang, Yu Shang and Lu Cai*, A deformation energy-based model for predicting nucleosome dyads and occupancy. Sci. Rep. 2016, 6:24133(SCI, IF5.578)

2.Yongqiang Xing, Xiujuan Zhao, Tao Yu, Dong Liang, Jun Li, Guanyun Wei, Guoqing Liu, Xiangjun Cui, Hongyu Zhao, Lu Cai*, MiasDB: A Database of Molecular Interactions Associated with Alternative Splicing of Human Pre-mRNAs. Plos One, 2016, 11(5): e0155443. (SCI, IF3.234)

3.Xiang-Jun CuiLu Cai, Yong-Qiang Xing, Xiu-Juan Zhao, Chen-Xia ShiInfluence factors on the correlations between expression levels of neighboring pattern genes. Biosystem, 2016, 139:23-28. (SCI, IF1.784)

4.Guoqing Liu*, Yongqiang Xing, Lu Cai*. Using weighted features to predict recombination hotspots in Saccharomy cescerevisiae. Journal of Theoretical Biology, 2015, 382:15-22 (SCI, IF2.5)

5.Hongyu Zhao, Yongqiang Xing, Guoqing Liu, Ping Chen, Xiujuan Zhao, Guohong Li*, Lu Cai*. GAA triplet-repeats cause nucleosome depletion in the human genome. Genomics, 2015, 106:88-95 (SCI, IF3.32)

6.G-Q Liu* F Feng X-J Zhao and L Cai*, Nucleosome Organization around Pseudogenes in the Human GenomeHindawi Publishing Corporation. BioMed Research International 2015, Article ID 821596 (SCI IF1.579)

7.Wantong Si, Jumei Liu, Lu Cai, Haiming Jiang, Chunli Zheng, Xiaoying He, Jianying Wang and Xuefeng Zhang. Health Risks of Metals in Contaminated Farmland Soils and Spring Wheat Irrigated with Yellow River Water in Baotou, China. Bull Environ Contam Toxicol (2015) 94:214–219

8.Alok Sharma, Hieu Nguyen, Lu Cai and Hua Lou, Histone hyperacetylation and exon skipping: a calcium-mediated dynamic regulation in cardiomyocytes. Nucleus, 2015, 6(4):273-278 (SCI IF3.15)

9.Yongqiang Xing, Guoqing Liu, Xiujuan Zhao, Hongyu Zhao and Lu Cai*, Genome-wide characterization and prediction of Arabidopsis thaliana replication origins. Biosystem 2014, 124:1-6 (SCI, IF1.784)

10.Binjie ZangGuoqing Liu and Lu Cai, Predicting recombination hot/cold spots in Saccharomyces cerevisiae from multiple information. Chinese SCI Bull. 2014; 59(11):953. (SCI, IF1.321)

11.Yong-qiang Xing & Guo-qing Liu & Xiu-juan Zhao &Lu Cai*An analysis and prediction of nucleosome positioning based on information content. Chromosome Res. (2013) 21:63–74 (SCI, IF3.23)

12.Chunli Zheng Yanjun Li Li Nie Lin Qian Lu Cai* Jianshe Liu, Transcriptional and Functional Studies of a Cd(II)/Pb(II)-Responsive Transcriptional Regulator(CmtR)from Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270. Curr. Microbiol. 2012: 65(2):117-121 (SCI, IF1.33)

13.Guoqing Liu; Jia Liu; Xiangjun Cui; Lu Cai, Sequence-dependent prediction of recombination hotspots in Saccharomyces cerevisiae J Theor. Biol. (2012) 293: 49-54 (SCI, IF2.5)

14.Yongqiang Xing Xiujuan Zhao and Lu Cai*, Prediction of nucleosome occupancy in Saccharomyces cerevisiae using position-correlation scoring function. Genomics (2011) 98:359-366 (SCI, IF3.32)

15.Libing Ma, Lu Cai, Jiajia Li, Xiuli Chen and Fengyu Ji, Two-staged nuclear transfer can enhance the developmental ability of goat–sheep interspecies nuclear transfer embryos in vitro. In Vitro Cell Dev Biol Anim. (2011) 47(2):95-103. (SCI, IF1.49)

16.Jiantao Yu, Maozu Guo, Chris J. Needham, Yangchao Huang, Lu Cai and David R. Westhead, Simple sequence-based kernels do not predict protein-protein interactions. Bioinformatics (2010) 26(20):2610-2614 (SCI, IF 4.926)

17.Xiujuan Zhao Zhiyong Pei Jia Liu and Lu Cai*, Prediction of Nucleosome DNA Formation Potential and Nucleosome Positioning Using Increment of Diversity Combined with Quadratic Discriminant Analysis, Chromosome Res. (2010) 18:777-785 (SCI, IF 3.23)

18.Guoqing Liu, Hong Li, Lu Cai. Processed pseudogenes are located preferentially in regions of low recombination rates in the human genome. (2010) J. Evol. Biol. 23(5):1107–1115. (SCI, IF: 3.4)

19.S-H Kim, Lu Cai, M. J. Pytlos, and R. R. Sinden, Ligation of (CAG)n•(CTG)n repeats flanked with only G and C overhang ends produces long uninterrupted repeats in vitro. (2005) BioTechniques 38(2) 247-253 (SCI, IF2.38)

20.Lu Cai, DNA Curvature of (CCTG)n·(CAGG)n and (ATTCT)n·(AGAAT)n Repeats Sequences, (2005) International J Mod. Phys. B 19(15-17) 2921-2926 (SCI 0.7)

21.Lu Tsai, Liaofu Luo and Zhirong Sun, Sequence-dependent flexibility in promoter sequences. (2002) J.Biomolec. Struc. Dynam. 20(1), 127-134 (SCI, IF 1.8)

22.Lu Tsai and Zhirong Sun, The dynamic flexibility in Escherichia coli genome. (2001). FEBS Letters 507(2),225-230. (SCI IF 3.7)

23.Lu Tsai and Liaofu Luo, A statistical mechanical model for predicting B-DNA curvature and flexibility (2000, 11 ) J. Theor. Biol. 207, 177-194 (SCI IF2.5)

24.Liaofu Luo, Weijiang Lee , Lijun Jia, Fengmin Ji and Lu Tsai, Statistical correlation of nucleotides in a DNA sequence, Phys. Rev. E,1998,Vol.58,No.1,861 (SCI, IF2.0)

25.Liaofu Luo Lu Tsai and Weijiang Lee, Model of evolution of Molecular Sequence, Phys. Rev. A ,1990,Vol.41,5441-5450 (SCI, IF3.047)

26.L.F.Luo L.Tsai and Y.M.Zhou,The informational parameters of nucleic acid and molecular evolution, J. Theor. Biol.,1988,Vol.130,351-361 (SCI, IF2.264)

27.Luo Liaofu and Cai LuSqueezing effect from photon scatteringChinese Phys. Lett. 1986, Vol.3 No.145-47 (SCI, IF1.135)

28.Luo Liaofu and Cai LuFractal dimension of Nucleic Acid sequences and Its Relation to Evolutionary Level,Chinese Phys. Lett.,1988,Vol.5,No.9,421 (SCI, IF1.135)

EIISTP收录论文(*号为责任作者)

29.XiangJi, Jinrong Wang, Xiaoli Miao, Kaihua Liu and Lu Cai*. Stress of nutrients deficiency on growth and lipid accumulation in oil-rich Navicula sp. Applied Mechanics and Materials, v 521, p 68-71, 2014, Sustainable Energy (EI: 20141117442278)

30.Lu Cai, Zhiyong Pei, Sheng Qin and Xiujuan Zhao Prediction of Protein-Protein Interactions in Saccharomyces cerevisiae Based on Protein Secondary Structure 2012 International Conference on Biomedical Engineering and Biotechnology (ICBEB)  Marco, 413-415 EI20124015484716

31.Ji Xiang  Zhang Shaomig and Cai Lu* A two-step heterogeneous catalyzed process for biodiesel production Advanced Materials Research, v 512-515, p 330-333, 2012, Renewable and Sustainable Energy II (EI:20122315084505 CPCI-S WOS:000312119900066)

32.Wang Lei Wang Wangui Ji Xiang andCai Lu* Screening of lignin-degrading fungus and its potential use in biopulping 16th International Symposium on Wood, Fiber and Pulping Chemistry - Proceedings, ISWFPC, v 2, p 1158-1162, 2011, (EI:20120314681441)

33.Hongyu Zhao, Yue Zhao, Rong Chai, Lu Cai*Instability of the DNA repeats mutation in humans hereditary disorders2011 International Conference on Remote Sensing, Environment and Transportation EngineeringRSETE 2011),6899-6902.EI20113614293516

34.Lei Wang Wangui Wang Xiang Ji and Lu Cai*, Biodegradation of lignin by the white rot fungus Polyporus varius and its promising potential for biopulping. ICMREE2011-Proceedings 2011 International Conference on Materials for Renewable Energy and Environment, v 1, p 464-468, 2011 (EI 20113014174557)

35.Xiang Ji Zhihui Zhang and Lu Cai*, Culture of chlorella spp and optimization of growth condition. Applied Mechanics and Materials, v 71-78, p 2887-2890, 2011, Frontiers of Green Building, Materials and Civil Engineering (EI:20114414470614)

36.Lu Cai, Sheng Qin and Zhiyong Pei. Hub-protein classification and interaction rules in protein-protein interaction networks in Saccharomyces cerevisiae. FSKD'11 2011shanghai. (EI20114014401024)

37.Lu Cai and Ji Xiang. Studies on the Isolation of Lipase-producing Strain and Immobilized Condition. Asia-Pacific Power and Energy Engineering Conference (APPEEC 2010), 2010.3  -Proceedings (EI 20102212971455)

38.Xiujuan Zhao, Zhiyong Pei, Jia Liu, Sheng Qin, Songye Ren , Lu Cai*  Nucleosome Positioning Prediction in C. elegans Based on Increment of Diversity combined with quadratic discriminant analysis. The 3rd International Conference on Advanced Computer Theory and Engineering (ICACTE 2010) V1-266-268 (EI:20104613373624)

39.Lu Cai, Jia Liu and Xiujuan Zhao, Protein-Protein Interaction Prediction Using Increment of Diversity Combined with Quadratic Discriminant Analysis. The 2010 International Congress on Computer Applications and Computational Science (CACS 2010), December 2010, Singapore (EI)

40.季祥, 张智慧, 蔡禄*. Technology of producing biodiesel from spent bleaching earth. Power and Energy Engineering Conference (PEEC 2010) September 2010, Wuhan, 231-233 (ISTP:000290185600053)

41.季祥王金荣,蔡禄*. 营养盐胁迫对富油舟形藻生长和油脂积累的影响研究中国可再生能源科技发展大会论文集 (2010) 920-922. (ISTP)

42.于建涛,郭茂祖,蔡禄.  蛋白质相互作用及其网络预测方法研究进展.200712月)电子学报,35B12):1-7. (EI, 082411312783)

43.蔡禄孙之荣,大肠苷菌基因组结构柔性的研究,(2001,12) 电子学报, 29(12A), 1759-1761 (EI2002256980727)

44.展铁政蔡禄,张春燕,CdS/CdTe--CdS/Cu2S异质二重结薄膜太阳能电池的设计与计算,太阳能学报,1994,Vol.15,No.1, 50-56(EI:1994011197398)

45.展铁政张春燕,蔡禄,多晶CdS/Cu2S异质结太阳能光电流及转换效率的计算,太阳能学报,1993,Vol.14,No.4,317-324  (EI, 1994071333550)

46.Lu Cai, A statistical mechanical model on sequence-dependent DNA dynamic structure, (2004.9) International Workshop on Structures and Dynamics of Free and Deposited Clusters, Lanzhou, China (ISTP 955PE)

47.Tsai Lu and Luo Liaofu, The empirical prediction of B-DNA local helical twist and related theoretical implications, Proceedings of International symposium on Theor. biophys. and Biomath.1997,Inner Mongolia University,23-28 (ISTP BJ54P)

●专著与教材

1.蔡禄,生物信息学(41万字),2006年,北京,化学工业出版社

2.陈铭主编蔡禄参编(8万字),生物信息学,2012年,北京,科学出版社

3.蔡禄主编,表观遗传学前沿(50万字),2012年,北京,清华大学出版社

●专利

1.蔡禄,王蕾,季祥,卢庆华,纸浆生产过程中的预处理方法,发明专利:ZL201110263409.9

2.蔡禄马力通,李珺,一种针对低热值煤的生物质型煤的制备方法,发明专利:ZL201210498649.1

3.季祥蔡禄廖利民,刘凯华,一种利用螺旋藻养殖废水水培蔬菜的方法,发明专利:ZL201410238130.9

4.马力通,李珺,蔡禄,张永强,一种碱液处理泥炭制备沼气的方法,发明专利:ZL201410033037.4

5.司万童,蔡禄,蒋海明,刘菊梅,王建英,张雪峰,于污染场地两栖类保护型的W 型人工,发明专利:ZL201410031842.3

6.潘建刚蔡禄张艾艾,高国日,张金艳,一种利用浮萍为原料制备2,3-丁二醇的方法,发明专利:ZL201310627393.4

7.蒋海明,李侠,蔡禄,有毒物质在线检测及自动报警装置及有毒物质的监测方法,发明专利:ZL201310226890.3

8.李珺马力通,蔡禄,赫文秀,赵果荣,一种稀酸处理泥炭制备沼气联产有机肥料的方法,发明专利:ZL201310066412.0

9.马力通,李珺蔡禄,赵果荣,王大为,一种泥煤制备生物质型煤粘结剂联产生物质型煤和有机肥的方法,发明专利:ZL201210504320.1

10.司万童,蒋海明,刘菊梅,蔡禄,王建英,张雪峰,单细胞凝胶电泳抽屉式水平冰浴电泳槽,实用新型:ZL201420043099.9

11.司万童,蔡禄,蒋海明,刘菊梅,王建英,张雪峰,带水封防干罩碘量瓶,实用新型:ZL201420043439.8

12.司万童,刘菊梅,蒋海明,蔡禄,王建英,张雪峰,高盐农灌退水处理兼土壤改良型人工湿地构建,实用新型:ZL201420043167.1

13.司万童刘菊梅,蒋海明,蔡禄,王建英,张雪峰,用于污染场地两栖类保护型的W 型人工,实用新型:ZL201420043400.0

14.张超君蔡禄潘建刚,一种简易厌氧发酵装置,实用新型:ZL201320890050.2

15.潘建刚蔡禄,高国日,张艾艾,常亚,一种半自动浮萍采集、晾晒装置,实用新型: ZL201320644518.X

16.潘建刚,蔡禄,张艾艾,一种蛭石草炭土生境下磷脂脂肪酸提取组合装置,实用新型公告号:ZL201320644517.5

●教学情况

为本科生、研究生讲授过《量子力学》、《非平衡统计物理学》、《大学物理学》、《生物物理学》、《生物信息学》、《遗传学研究进展》和《分子遗传学》等课程。

版权所有:内蒙古科技大学生命科学与技术学院 电话:0472-5951944(行政) 0472-5953204(学工)
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